Pilates en Yoga hebben verschillende ademhalingsmethoden. Pilates is in- en uitademen door de neus en uitademen door de mond, terwijl yoga in- en uitademen door de neus is. De meeste mensen ademen door de buik, kunnen door de borst ademen of volledig ademen.
En de trainingsintensiteit van de twee is ook verschillend. De trainingsintensiteit van Pilates-bewegingen zal groter zijn. Omdat de trainingsintensiteit van Pilates-bewegingen groter is, vereist het oefenproces meer fysieke kracht. Yoga oefent echter meer onze flexibiliteit uit, dus de intensiteit is niet zo groot, maar als je een vriend bent die net met yoga-oefeningen is begonnen, kun je spierpijn voelen.
De effecten die door yoga en Pilates worden bereikt, zijn ook verschillend. Yoga verandert vooral de fysiologie en psychologie van mensen om een staat van evenwicht te bereiken. Pilates heeft een beter effect op de lichaamsvorm en kan de lichaamsvorm van mensen verbeteren.

